Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Nf1Q04690 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms