Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SrprbP47758 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms