Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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