Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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RxraP28700 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RxraP28700 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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