Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pou3f1P21952 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms