Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Myo5bP21271 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms