Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TP20293 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TP20293 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TP20293 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TP20293 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TP20293 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TP20293 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TP20293 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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