Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb2P13373 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms