Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tgfb1P04202 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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