Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm8005F6YKY3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms