Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms