Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprbB2RU80 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprbB2RU80 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms