Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atp8b5A3FIN4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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