Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pdpk1Q9Z2A0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pdpk1Q9Z2A0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pdpk1Q9Z2A0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pdpk1Q9Z2A0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pdpk1Q9Z2A0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pdpk1Q9Z2A0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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