Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms