Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Trim39Q9ESN2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Trim39Q9ESN2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Trim39Q9ESN2 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Trim39Q9ESN2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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