Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Usp12Q9D9M2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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