Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifi35Q9D8C4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms