Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Snx29Q9D3S3 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx29Q9D3S3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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