Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg3Q9CPX6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms