Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp11Q99K46 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms