Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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