Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc9Q8CDN9 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms