Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cwc22Q8C5N3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cwc22Q8C5N3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cwc22Q8C5N3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cwc22Q8C5N3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cwc22Q8C5N3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cwc22Q8C5N3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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