Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms