Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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PtprdQ64487 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprdQ64487 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms