Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tdrd5Q5VCS6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tdrd5Q5VCS6 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tdrd5Q5VCS6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms