Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trp53i11Q4QQM4 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms