Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Lrrc43Q3V0L5 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms