Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms