Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms