Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms