Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms