Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms