Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Nlrp9b-202ENSMUST00000117909 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms