Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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NfiaQ02780 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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