Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms