Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gfi1P70338 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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