Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtprmP28828 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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PtprmP28828 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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