Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms