Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms