Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ambra1A2AH22 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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