Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Col5a3Q9JLI2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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