Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms