Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Trim39Q9ESN2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Trim39Q9ESN2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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