Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Zbed3Q9D0L1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Zbed3Q9D0L1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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