Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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