Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrit1Q8K099 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lrit1Q8K099 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lrit1Q8K099 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lrit1Q8K099 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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