Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rbm28Q8CGC6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms