Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms